根据中国相关法律法规和行业规定，C证（即建筑企业安全生产许可证C类）和二级建造师资格证书是可以注册在两家不同的单位的。但是，这种注册需要满足以下条件：
1. 合法注册：二级建造师和C类安全生产许可证都需要在各自的单位进行合法注册，不能有虚假注册或违规操作。
2. 专业对口：二级建造师注册的专业应与C类安全生产许可证所对应的专业相匹配。
3. 不得兼职：根据《注册建造师管理规定》，注册建造师不得同时在两家及以上单位受聘或者执业。
4. 单位同意：需要两家单位都同意注册，并且遵守各自单位的规章制度。
5. 法律法规：必须遵守国家关于注册建造师和安全生产许可证的相关法律法规。
在实际操作中，如果二级建造师和C类安全生产许可证需要在不同的单位注册，需要按照以下步骤进行：
向原注册单位提出申请，说明情况并办理注销手续。
准备相关材料，如身份证、资格证书、劳动合同等，向新单位提出注册申请。
新单位审核通过后，向相关部门提交注册申请。
在遵守相关法律法规和单位规定的前提下，二级建造师和C类安全生产许可证是可以注册在两家不同单位的。但具体操作时，还需根据实际情况和当地规定来执行。
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